Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC127Q96BQ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC127Q96BQ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC127Q96BQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms