Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC17Q96AE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC17Q96AE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC17Q96AE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms