Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYAP1Q96A49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYAP1Q96A49 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYAP1Q96A49 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms