Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERGIC1Q969X5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERGIC1Q969X5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERGIC1Q969X5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms