Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3Q969T4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3Q969T4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2E3Q969T4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms