Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-CQ95604 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-CQ95604 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-CQ95604 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-CQ95604 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms