Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3AQ92664 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3AQ92664 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms