Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF4Q92544 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF4Q92544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms