Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX19Q92543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX19Q92543 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX19Q92543 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms