Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY2Q8WXA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY2Q8WXA3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY2Q8WXA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY2Q8WXA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY2Q8WXA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RUFY2Q8WXA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RUFY2Q8WXA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RUFY2Q8WXA3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms