Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC12Q8WVT3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC12Q8WVT3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms