Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BRK1Q8WUW1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BRK1Q8WUW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BRK1Q8WUW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms