Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB2BQ8WUD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB2BQ8WUD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB2BQ8WUD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms