Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHBDD1Q8TEB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1Q8TEB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1Q8TEB9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms