Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF398Q8TD17 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF398Q8TD17 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF398Q8TD17 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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