Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCD1

C18orf32, UPF0729 protein C18orf32, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf32Q8TCD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf32Q8TCD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf32Q8TCD1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms