Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL4L1Q8NHW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCL4L1Q8NHW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL4L1Q8NHW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL4L1Q8NHW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms