Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP61Q8NHU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP61Q8NHU2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP61Q8NHU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP61Q8NHU2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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