Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP2Q8ND30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIBP2Q8ND30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms