Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM35BQ8NCS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM35BQ8NCS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM35BQ8NCS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms