Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RDH13Q8NBN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RDH13Q8NBN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RDH13Q8NBN7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RDH13Q8NBN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms