Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC63Q8NA47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC63Q8NA47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC63Q8NA47 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms