Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8F6

YIPF7, Protein YIPF7, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF7Q8N8F6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF7Q8N8F6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF7Q8N8F6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF7Q8N8F6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF7Q8N8F6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms