Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00612Q8N6U2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00612Q8N6U2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00612Q8N6U2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms