Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDCL2Q8N4E4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDCL2Q8N4E4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 578 ms