Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA5B2Q8N398 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VWA5B2Q8N398 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms