Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC117Q8IWD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC117Q8IWD4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC117Q8IWD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms