Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC22A9Q8IVM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A9Q8IVM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC22A9Q8IVM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A9Q8IVM8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms