Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC49Q8IUZ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC49Q8IUZ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC49Q8IUZ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms