Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSIG1Q86XK7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VSIG1Q86XK7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VSIG1Q86XK7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VSIG1Q86XK7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms