Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZD3Q86UT5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD3Q86UT5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD3Q86UT5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms