Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA11Q86U17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINA11Q86U17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINA11Q86U17 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms