Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCGF5Q86SE9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCGF5Q86SE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF5Q86SE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCGF5Q86SE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms