Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RD3Q7Z3Z2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RD3Q7Z3Z2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RD3Q7Z3Z2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms