Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM179Q6ZVK1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM179Q6ZVK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM179Q6ZVK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM179Q6ZVK1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM179Q6ZVK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM179Q6ZVK1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM179Q6ZVK1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM179Q6ZVK1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM179Q6ZVK1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms