Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC73Q6ZRK6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC73Q6ZRK6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms