Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEX3BQ6ZN04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEX3BQ6ZN04 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEX3BQ6ZN04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms