Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG3Q6UXM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG3Q6UXM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG3Q6UXM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG3Q6UXM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms