Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATRAIDQ6UW56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATRAIDQ6UW56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRAIDQ6UW56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms