Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJW8

CNST, Consortin, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNSTQ6PJW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNSTQ6PJW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNSTQ6PJW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNSTQ6PJW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNSTQ6PJW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms