Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB12Q6IQ22 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB12Q6IQ22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB12Q6IQ22 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms