Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMYD5Q6GMV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD5Q6GMV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD5Q6GMV2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms