Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIST2H2AA3Q6FI13 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIST2H2AA3Q6FI13 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST2H2AA3Q6FI13 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms