Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUPD1Q68J44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
DUPD1Q68J44 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms