Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RNF43Q68DV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF43Q68DV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF43Q68DV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms