Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM198Q66K66 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM198Q66K66 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM198Q66K66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms