Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF13Q5VWM6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF13Q5VWM6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF13Q5VWM6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms