Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD1Q5VV17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD1Q5VV17 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTUD1Q5VV17 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms