Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC181Q5TID7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC181Q5TID7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC181Q5TID7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms