Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAMD5Q5TGI4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD5Q5TGI4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD5Q5TGI4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms